Next-Generation Sequencing Data Analysis

图书简介

This book walks readers through the multiple stages of next-generation sequencing (NGS) data generation and analysis in an easy-to-follow fashion. It covers every step in each stage, from the planning stage of experimental design, sample processing, sequencing strategy formulation, the early stage of base calling, reads quality check and data preprocessing to the intermediate stage of mapping reads to a reference genome and normalization to more advanced stages specific to each application. It also covers all major applications of NGS.

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Harvard Library

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Introduction to Cellular and Molecular Biology: The Cellular System and the Code of Life. DNA Sequence: The Genome Base. RNA: The Transcribed Sequence. Introduction to Next-Generation Sequencing (NGS) and NGS Data Analysis: NGS Technologies: Ins and Outs. Early-Stage NGS Data Analysis: Common Steps. Computing Needs for NGS Data Management and Analysis. Application-Specific NGS Data Analysis: Transcriptomics by RNA-Seq. Small RNA Sequencing. Genotyping and Genomic Variation Discovery by Whole Genome Resequencing. De novo Genome Assembly from NGS Reads. Mapping Protein?DNA Interactions with ChIP-Seq. Epigenomics and DNA Methylation Analysis by NGS. Metagenome Analysis by NGS. The Changing Landscape of NGS Technologies and Data Analysis: What Is Next for NGS? Appendices. References. Index.

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